Urodzony w Paryżu w 1656 roku był jedną z czołowych postaci rozwijającej się wówczas szkoły francuskiej. Studiował kompozycję u Lully oraz pobierał lekcje od Sainte-Colombe. Był znakomitym wirtuozem violi da gamby, dzięki czemu w 1676 roku udał się do Wersalu, gdzie dał koncert na dworze Ludwika XIV. Tam pozostał aż do 1725 roku grając na dworze królewskim. Jego dzieła to głównie utwory napisane na violę da gambę (np. „La Folia”, „Sonnerie de Sainte Geneviève”, „Le Badinage”), a najważniejsze z nich były wydane w 5 albumach między 1686 a 1725 rokiem. W ten sposób rozreklamował ten instrument oraz pokazał jego zdolności i możliwości, których wówczas nie znano. Marais pisał również opery, w tym „Alcione”, „Semele” oraz „Alcides” napisaną wraz z Lully. Miał 19 dzieci, z których większość stała się znanymi muzykami. Zmarł w 1728 roku w Paryżu.